Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 363.1 ms