Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VdrP48281 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VdrP48281 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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