Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms