Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PtprmP28828 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PtprmP28828 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PtprmP28828 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
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PtprmP28828 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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PtprmP28828 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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