Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VimP20152 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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