Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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