Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.7 ms