Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm21060J3KMU4 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms