Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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