Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms