Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hmg20aQ9DC33 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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