Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rab28Q99KL7 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rab28Q99KL7 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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