Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms