Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ccdc17Q8CE13 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc17Q8CE13 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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