Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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