Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms