Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms