Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrp1P56183 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms