Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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VdrP48281 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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