Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms