Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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P10404 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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P10404 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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P10404 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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P10404 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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P10404 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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