Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm3415J3QMS8 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3415J3QMS8 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms