Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
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Spocd1B1ASB6 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
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Spocd1B1ASB6 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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