Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms