Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms