Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms