Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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