Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trak1Q6PD31 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms