Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Q3U6N9 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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