Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms