Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
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Ttc21bQ0HA38 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms