Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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