Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Usp25P57080 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms