Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Tsta3P23591 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Tsta3P23591 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Tsta3P23591 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Tsta3P23591 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Tsta3P23591 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Tsta3P23591 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Tsta3P23591 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsta3P23591 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms