Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
P10404 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms