Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms