Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ifnb1P01575 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms