Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
KeraO35367 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
KeraO35367 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms