Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms