Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm28048F7BCN0 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms