Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Scn3aA2ASI5 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Scn3aA2ASI5 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Scn3aA2ASI5 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Scn3aA2ASI5 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms