Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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