Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms