Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms