Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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