Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PtprtQ99M80 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PtprtQ99M80 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprtQ99M80 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprtQ99M80 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprtQ99M80 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprtQ99M80 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprtQ99M80 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprtQ99M80 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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