Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ccdc38Q8CDN8 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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