Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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