Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Q3U6N9 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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