Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rpusd3Q14AI6 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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